"Buono" è un aggettivo e descrive un nome. "Bene" è un avverbio e descrive un verbo, un aggettivo o un altro avverbio. La scelta dipende dalla funzione nella frase, non dal significato generico di "cosa positiva".

Regola
"Buono" descrive un nome.
"Bene" descrive un verbo.
"Bene" può rafforzare un aggettivo o un avverbio.

"Buono" si accorda con il nome in genere e numero. Si usa per qualità di persone, cose, cibo, idee o situazioni quando il sostantivo è il centro della valutazione. Nelle frasi con "essere" + nome implicito o esplicito, resta una valutazione del nome.

Soggetto	Forma
Singolare maschile	buono
Singolare femminile	buona
Plurale maschile	buoni
Plurale femminile	buone

"Bene" è invariabile perché non si accorda. Si usa per valutare come si compie un'azione. Si usa anche in espressioni fisse come "va bene" dove si giudica il risultato o la situazione come soddisfacente.

Parola o frase	Definizione
bene	Si usa per dire che qualcosa è fatto in modo soddisfacente.
andare bene	Si usa per dire che qualcosa funziona o procede nel modo desiderato.
va bene	Si usa per esprimere accordo o accettazione di una proposta o situazione.

Per scegliere tra "buono" e "bene", identifica cosa viene descritto: se è un nome, scegli "buono"; se è un verbo, scegli "bene". Nella frase "Il caffè è buono" il centro è "caffè". Nella frase "Parli bene" il centro è "parlare".

Regola
Se stai qualificando un nome, usa "buono".
Se stai qualificando un verbo, usa "bene".

"Buono" si comporta come un aggettivo e si accorda con il nome. "Bene" si comporta come un avverbio e resta invariato. La scelta corretta dipende da cosa stai qualificando nella frase.